质谱法主要用于中药、化学药和生物药的研发、生产和上市后质量监测与评 价。在真菌毒素（通则 2351 和指导原则 9305 ）、农药残留（通则 2341 ）、药品 杂质（指导原则 9102 ）、金属元素（通则 2321 、 2322 、 3208 、指导原则 9304 ）、 色素（指导原则 9303 ）、药物（通则 3405 、指导原则 9015 ）及其代谢物、内源 性核酸和蛋白质等微量或复杂成分分析中应用广泛。质谱法还可用于细菌、真菌 分类与鉴定、分子成像分析等